کدون اغاز

کدون آغاز. کدون آغاز نخستین کدون رونوشت آران ای پیام رسان ( mRNA ) است که توسط یک ریبوزوم، ترجمه شده است. کدون آغاز، همیشه متیونین را در یوکاریوت ها و آرکی ها و یک ان - فورمیل متیونین را در باکتری ها، میتوکندری ها و پلاست ها کد می کند. رایج ترین کدون آغاز، AUG است ( یعنی ATG در توالی دی ان ای مربوطه ) .
پیش از کدون آغاز، یک ناحیهٔ ترجمه نشدهٔ ۵' ( 5' UTR ) قرار می گیرد. در پروکاریوت ها این ناحیه، شامل محل اتصال ریبوزوم است.
کدون های آغاز جایگزین با کدون استاندارد AUG متفاوت هستند و هم در پروکاریوت ها ( باکتری ها و آرکی ها ) و هم در یوکاریوت ها یافت می شوند. کدون های آغاز جایگزین، زمانی که در شروع یک پروتئین هستند، همچنان به عنوان متیونین ترجمه می شوند ( حتی اگر کدون، یک اسید آمینهٔ متفاوت را در حالت معمول، کدگذاری کند ) . این به این دلیل است که یک آران ای حامل جداگانه ( tRNA ) برای آغاز استفاده می شود. [ ۱]
کدون های آغاز جایگزین ( غیر AUG ) در ژنوم های یوکاریوتی بسیار نادر هستند. با این حال، کدون های شروع غیر AUG به طور طبیعی برای برخی از آران ای های پیام رسان سلولی گزارش شده است. [ ۲] هفت مورد از ۹ جایگزینی تک نوکلئوتیدی ممکن در کدون آغازی AUG دی هیدروفولات ردوکتاز به عنوان سایت های شروع ترجمه در سلول های پستانداران کاربردی بودند. [ ۳] علاوه بر مسیر کدون متعارف متیونین - tRNA متیونین و AUG، سلول های پستانداران می توانند ترجمه با لوسین را با استفاده از یک لوسیل - tRNAی خاص که کدون CUG را رمزگشایی می کند، آغاز کنند. [ ۴] [ ۵]
کاندیدا آلبیکنس از کدون آغاز CAG استفاده می کند. [ ۶]
پروکاریوت ها به طور قابل توجهی از کدون های آغاز جایگزین استفاده می کنند ( به طور عمده GUG و UUG ) . این کدون های آغاز، متناوب و فراوانی استفاده از آن ها در مقایسه با یوکاریوت ها مورد مطالعه قرار گرفت و نظریهٔ اجداد مشترک را رد کرد.
ا[ ۷] [ ۸]
نواحی کدگذاری معروفی که کدون های آغازین AUG ندارند، مناطق lacI ( GUG ) [ ۹] [ ۱۰] و lacA ( UUG ) [ ۱۱] در اشریشیا کلی اپران لک هستند. دو مطالعهٔ جدیدتر به طور مستقل نشان داده اند که ۱۷ یا بیشتر کدون آغاز غیرAUG ممکن است ترجمه را در اشریشیا کلی آغاز کنند. [ ۱۲] [ ۱۳]
ژنوم های میتوکندریایی از کدون های آغاز متناوب به طور قابل توجهی استفاده می کنند ( AUA و AUG در انسان ) . بسیاری از این نمونه ها، با کدون، محدودهٔ سیستماتیک، و نقل قول، در فهرست جداول ترجمه مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری ( NCBI ) آورده شده است. [ ۱۴]